HBrO3与HSeO3的酸性可以通过其共有的共轭碱性比较。HBrO3的共轭碱是BrO3-，而HSeO3的共轭碱是SeO3^2-。
由于溴酸根离子（BrO3-）比亚硒酸根离子（SeO3^2-）大，电子分布更加分散，所以BrO3-离子更稳定，更难再失去质子，对应的HBrO3就是弱酸。相反，SeO3^2-离子比较小，电子云更加紧密，所以更容易再失去质子，对应的HSeO3就是较强的酸。
因此，HBrO3相对于HSeO3来说更弱酸。
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